由张雪迎一人两角分身饰演的双胞胎姐妹初音音和夏儿阴差阳错互换身份，前者是傲娇学霸，精英校园的风云人物。
而后者则是职业学院的中二少女，生存技能max的草履虫单细胞生物。截然不同的姐妹二人互换身份后，展开了一段有关青春、爱情、家族的错综故事。
首播剧情高能，青藤国际学院是一所国内一流本科院校，里面就读的学生大部分都为出国努力，初音音是这所学校的学霸，但已经失踪三天了，她母亲报警，同学们议论纷纷，警察也来学校调查。
初音音同学许空凛突然收到一份包裹，送货单上写的是寿司，但里面却什么都没有，他急忙拿去给正在学校调查的刘警官，认为送货单上的英文三个单词第一个字母合起来是SOS，是求救信息。
刘警官拿着包裹单去找初音音的母亲初总，初总正为女儿的失踪忧心忡忡，听警察说明来意，初总也不知道怎么回事，助理小梅看到包裹有些紧张，只说这个包裹是三天前初音音让她寄的，其余就不知道了，初总让小梅到处张贴寻人启事，赏金两万寻找初音音。
而初音音的双胞胎妹妹是新南方职业技术学院的学生，此时的她整备刘强追债!她好容易摆脱了追赶，要去找兼职赚钱还账，她没注意到与一个和自己长得一模一样的女孩擦肩而过。
就这样，张雪迎饰演的傲娇校花初音音意外失踪，和其样貌相似的夏儿被误认进入初家，初音音失踪留下线索，校园男神许空凛担心之际，夏儿以初音音的身份回归青藤国际学院。
新来的转学生李白(王博文饰)被夏儿的精灵古怪吸引，甘当夏儿的黑骑士，三人校园初见的甜蜜纠葛为之后的剧情走向埋下伏笔。
以失忆为借口留在青藤的夏儿无意中发现自己和初音音之间的血缘之谜，面对身边人的怪异举止，以及越来越多浮出水面的线索，夏儿决定留下找出真相，誓要解开初音音失踪的原因，几个年轻人组成“侦探小队”，开启校园冒险之旅。
另一边初音音来到夏儿生活过的新南方职业技术学院，被偷袭失忆的初音音在找寻自我的过程中，也默默影响着身边的人。
据悉，李妮可和爸爸一起去体检时遇到了初音音的妈妈，更是无意间发现初总的血型是ab型，但是初音音的血型是O型，这就说明初音音不是初总新生的。
所以她开始找线索，无意间在齐晓儿的视频中发现了夏儿，这时候初音音才知道自己有一个双胞胎姐妹。而初音音离家出走就是为了去找自己的妹妹夏儿!
所以初音音就去新南方职业学院去找夏儿，值得一提的是初音音就是在夏儿的学校门口遇害的，当时两人还擦肩而过!
当然从剧情来看，许空凛推测初音音离家出走有三大原因。因为初音音自恃清高，但抗压能力太弱，一系列的事件发生让她不能接受。
其一就是初音音和许空凛玩敢不敢的游戏，两人约定好一起考F，但是许空凛却考出了A，这让初音音觉得许空凛背叛了她。
第二就是初音音和李妮可之间的较量，当从李妮可口中得知自己不是亲生的，所以很崩溃。
第三当然就是知道自己不是亲生的，无法接受，再加上初总对她要求太高，突然的叛逆期来临。
当然小编还是认为初音音“离家出走”的最大原因就是寻找自己的妹妹夏儿!
值得一提的是，《青春最好时》以青藤学院和新南方职业技术学院两所学校为故事背景，一所是顶尖名校，一所是职业院校。
青藤学院的学生只看分数，为了争夺国外名校的升学名额竞争激烈，新南方学院的学生以就业为目的，课程也以烹饪、美容美发、计算机等专业为主。两所学校学习氛围不同，学生性格也相差很大，初夏姐妹的身份互换改变了两所学校的画风。
青藤学院不再一味的注重成绩，新南方学院的学生也逐渐认识到了学习的重要性。剧中融入了很多当下备受学生们关注的元素，直播、学习、运动会、比赛、升学等，这种对于真实学校生活的展现，是该剧的一大亮点。
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